對醫藥潔凈廠房空調系統設計時，需要嚴格按照藥品生產質量管理規范及相應規范法規對環境的基本要求；根據相關規范及法規對空調系統進行合理劃分，設計時還要充分考慮藥品生產過程和生產設備對空氣品質所產生的不利影響。

一、設計初期首先要熟悉潔凈度、微生物限度及其監測的一般要求。無菌藥品：新版GMP的附錄一第八條至第十三條。潔凈度分為A、B、C、D4個級別。A級：高風險操作區，單向流、動靜態均為100級、均勻送風、風速為0.36～0.54m/s (指導值)。在密閉的隔離操作器或手套箱內，可使用較低的風速。B級：高風險操作A級區所處的背景區域，混合流、靜態百級動態萬級。C級和D級：重要程度較低的潔凈操作區。C級：混合流、靜態萬級動態10萬級。D級：混合流、靜態10萬級動態不規定。非無菌藥品：新版GMP的附錄一第五十一條：參照“無菌藥品”附錄中D級潔凈區的要求設置。非無菌原料藥生產及無菌原料藥生產中非無菌生產工序：新版GMP的附錄二第三條：應按照“無菌藥品”附錄中D級潔凈區的要求設置。中藥提取、濃縮、收膏工序：采用密閉系統生產的，其操作環境可在非潔凈區；采用敞口方式生產的，其操作環境應與其制劑配制崗位的潔凈度級別相適應。中藥注射劑濃配前的精制工序應至少在D級潔凈區內完成。

二、要充分考慮溫度與濕度對各潔凈區的硬性要求。當藥品生產無特殊要求時，潔凈室的溫度范圍可控制在18～26℃，相對濕度控制在45～65%。考慮到無菌操作核心區對微生物污染的嚴格控制，對該區域的操作人員的服裝穿著有特殊要求，故潔凈區的溫度和相對濕度可按如下數值設計：?A級和B級潔凈區：溫度20～24℃，相對濕度45～60%：C級和D級潔凈區：溫度20～24℃，相對濕度45～65%。當工藝和產品有特殊要求時，應按這些要求確定溫度和相對濕度。在醫藥潔凈廠房空調系統設計基本要求確定之后，根據室內參數，使用時間、生產區域等因素來劃分空調系統，在設計中，空調系統劃分既要符合GMP要求，避免交叉污染的同時還要滿足節能和運行管理的便利。醫藥潔凈廠房空調系統劃分存在兩種形式，非最終滅菌無菌藥品的空調系統和非無菌藥品的空調系統。非最終滅菌無菌藥品的空調系統劃分：應按A、B、C、D級區域獨立設置空調系統，扎蓋區應單獨設置空調系統。最終滅菌無菌藥品的空調系統劃分：A、B級應獨立設置空調系統，C、D級應首選分開設置空調系統，當面積很小時可以合用一套空調系統。

三、在設計時要充分考慮空氣品質對工序、設備、操作產生不利影響的要求。在藥品的生產過程中，會產生粉塵、有害氣體、氣味等污染物，需要有效消除污染物的影響。首先確定污染源的位置。再根據污染源的位置、尺寸、產生方式、產生量確定排風方式，排風方式有小室排風、局部排風、全面排風。為了消除污染物，最好是將污染源封閉的小室排風，使小室相對于周圍環境負壓，但是這種方法往往是難以實現的，因為它常常.不能與操作上的要求相協調。其次是局部排風，在靠近污染源處捕集散發的污染物，排風裝置不僅要有必要的抽吸動力，還一定要有同污染物相適配的抽吸裝置。全面排風，這種方式需要較大的空氣量，對能源的浪費較大，因此只有在上述兩種方法無法實施時才予以考慮。排出的氣體還需要對有害物質進行處理首先要確定有害氣體的種類、性質(物理性質和化學性質)、數量。分析哪些需要單獨處理、哪些需防爆處理、哪些需要防腐處理、哪些需要防塵處理等等。如青霉素等高致敏性工序排風需單獨處理，乙醇等易燃易爆有機溶媒氣體需防爆處理、能產生化學反應的粉塵氣體不能合并處理、粉塵氣體不能與水蒸汽等濕氣合并處理、印刷等有異味的有機氣體要吸附處理、水蒸汽和腐蝕性氣體需要防腐處理等。

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